Когда МакГонагалл говорила, что "через час вам будет плохо, а через день вы умрете", она имела в виду ситуацию после отмены трансфигурации. В состоянии же трансфигурации любое существо пребывает в "неживом" виде и поэтому в принципе не может умереть.
На самом деле, мы не знаем, зависят ли повреждения (и время жизни после отмены трансфигурации) от времени, проведённом в трансфигурированном состоянии. Судя по описанию МакГоннагал, должно зависеть. Вполне может быть, что после 10 лет в виде алмаза, вы проживёте после отмены трансфигурации всего несколько минут/секунд.
В реальности, одна из серий тестов, которые должен был провести исследовательский дуэт Гарри & Гермиона - это трансфигурировать кучу мышей в неживые объекты, на разный срок и в разные объекты, и проверить, сколько они проживут после отмены трансфигурации. Возможно, это не описано в фанфике, для того чтобы не портить людям впечатление от науки описанием "острого" эксперимента. Или, второй вариант, в библиотеке нашлась книга, описывающая уже проведённые исследования в этой области.
Спойлер: в конце фанфика, у Гарри был выбор - тащить тело в больницу в состоянии клинической смерти для немедленной попытки оживления (вероятность успешного оживления - процентов 50 в лучшем случае, при этом вполне возможны повреждения мозга), или трансфигурировать в алмаз для хранения - возможно, на десятилетия или даже столетия.