Крайне маловероятно. Во-первых, если принять стандартную на данный момент версию Квиррелморта, получится, что крестраж из Камня вообще не был создан - технология крестражей кажется Квиррелу бессмысленной + он ВРОДЕ БЫ никогда раньше не видел знака Даров. По отдельности довольно слабые свидетельства, но в сумме получается неплохо (узнав от Гарри об истинном назначении Камня, он попытался бы забрать его из тайника и связаться с мертвыми, а это бы как-то повлияло на сюжет).
Во-вторых, к убийству Гермионы определенно имеет отношение мистер ПиШ. Но судя по событиям времен Рождественских (или Пасхальных? Не помню. Война под водой, одним словом) Дамблдор и ПиШ - две разных личности. Дамблдору определенно незачем было ДВАЖДЫ вербовать Забини и портить отношения с Квиррелом, а потом стирать ему память.
Ну и, наконец, феникс дает некоторый иммунитет к таким вещам, как мне кажется.